去離子甲醯氨rna酶
㈠ RNA酶的作用場所
rna復制酶
rna
replicase
亦稱rna合成酶。是依賴於rna的聚合酶。是以「病毒rna」為模板,
4種
5′-三磷酸核苷[4種核糖核苷酸:腺嘌呤核糖核苷酸(a),鳥嘌呤核糖核苷酸(g),胞嘧啶核糖核苷酸(c),尿嘧啶核糖核苷酸(u)]為底物的合成rna的酶。是從感染rna型噬菌體或癌病毒的細胞分離出來的。對反應來說,mg2+是必要的,而且模板的特異性高,例如大腸桿菌qβ噬菌體的酶只能以qβ或類綠的噬菌體rna為模板。反應生成物具有與模板鏈完全相同(排除偶然的環境因素)的結構。而實際上rna復制酶中缺乏校正功能,因此rna復制時錯誤率很高。
㈡ dd水是去RNA酶的嗎
如果是直接買的ddH2O那應該是去RNase的,如果是你們實驗室自己製取的,那可以用DEPC進行處理,就可以認為是RNase free的。
㈢ 異硫氰酸胍一步法分離純化rna的時候為什麼不適合富含甘油三酯的脂肪組織
異硫氰酸胍一步法分離純化rna的時候為什麼不適合富含甘油三酯的脂肪組織
通過變性劑破碎細胞或者組織,然後經過氯仿等有機溶劑抽提RNA,再經過沉澱,洗滌,晾乾,最後溶解。但是由於RNA酶無處不在,隨時可能將RNA降解,所以實驗中有很多地方需要注意,稍有疏忽就會前功盡棄。
0 T3 z( F& _, D6 c% ^" h6 Y A6 _RNA提取的一般步驟
- O: Y+ x$ p# s8 U4 M9 S 所有RNA的提取過程中都有五個關鍵點,即:樣品細胞或組織的有效破碎;有效地使核蛋白復合體變性;對內源RNA酶的有效抑制;有效地將RNA從DNA和蛋白混合物中分離;對於多糖含量高的樣品還牽涉到多糖雜質的有效除去。但其中最關鍵的是抑制RNA酶活性。RNA的提取目前階段主要可採用兩種途徑:提取總核酸,再用氯化鋰將RNA沉澱出來;直接在酸性條件下抽提,酸性下DNA與蛋白質進入有機相而RNA留在水相。第一種提取方法將導致小分子量RNA的丟失,目前該方法的使用頻率已很低。( O( g; ^+ K) f+ i& ]% P
實驗步驟:
* l& d6 s5 e( q1 F( g2 | j, ^0 s 破碎組織→分離RNA→沉澱RNA→洗滌RNA→融解RNA→保存RNA。6 D8 }. Q; Y, g* X
1、 破碎組織和滅活RNA酶可以同步進行,可以用鹽酸胍、硫氰酸胍、NP-40、SDS、蛋白酶K等破碎組織,加入β-ME可以抑制RNA酶活性。
" s% f, `0 [1 d* m! ]0 e2、 分離RNA一般用酚、氯仿等有機溶劑,加入少量異戊醇,經過此步,離心,RNA一般分布於上層,與蛋白層分開。
& X. P) i) Y; L# u/ [3、 沉澱RNA一般用乙醇、3M NaAc(pH-5.2)或異丙醇。2 @0 d& z7 ?+ i, g1 @
4、 洗滌RNA使用70%乙醇洗滌,有時,為避免RNA被洗掉,此步可以省掉,洗滌之後可以晾乾或者烤乾乙醇,但是不能過於乾燥,否則不易溶解。
3 @% V" o9 v+ I1 J2 o9 k" z5、 融解RNA一般使用TE。
; L5 f. n6 }( S1 t% Z& J6、 保存RNA應該盡量低溫。為了防止痕量RNase的污染,從富含RNase的樣品(如胰臟、肝臟)中分離到的RNA需要貯存在甲醛中以保存高質量的RNA,對於長期貯存更是如此。從大鼠肝臟中提取的RNA,在水中貯存一個星期就基本降解了,而從大鼠脾臟中提取的RNA,在水中保存3年仍保持穩定。另外,長度大於4kb的轉錄本對於痕量RNase的降解比小轉錄本更敏感。為了增加貯存RNA樣品的穩定性,可以將RNA溶解在去離子的甲醯胺中,存於-70℃。用於保存RNA的甲醯胺一定不能含有降解RNA的雜物。來源於胰臟的RNA至少可以在甲醯胺中保存一年。當准備使用RNA時,可以使用下列方法沉澱RNA:加入NaAc至0.3M,12,000×g離心5分鍾。
& P3 [7 m* ^$ U$ _" ?
: F" x u* N( ?( I氯化鋰法提取總RNA:
" u; }' I! r' ^' ^& l 本方法用高濃度尿素變性蛋白並抑制RNA酶,用氯化鋰選擇沉澱RNA,其特別適合於從大量樣品中提取少量組織RNA,具有快速簡潔的長處,但也存在少量DNA的污染及RNA得率不高,小RNA片斷丟失的缺陷。# ~* S: }9 `* r4 Z3 P
試驗試劑:
" d$ r6 Q+ _. I8 Q1、 氯化鋰/尿素溶液【氯化鋰126g(3M) 尿素、360g(6M) 加水至1L,過濾滅菌】
7 _8 w1 t" o9 a' q! i4 Z2、 懸浮液【10mM? Tris-HCL (pH7.6) ,1mM? EDTA (pH8,0) ,0.5%SDS】
! m8 Q4 R, ]& y: b# `7 d試驗步驟:7 [6 ?$ `* }; o7 _ Z' {
1、 對於大量組織或細胞,則每克組織或細胞加入5-10ml氯化鋰-尿素溶液,勻槳器高速勻槳2分鍾;對於少量細胞(107個細胞/ml),則每克組織或細胞加入0.5ml氯化鋰-尿素溶液手工勻槳,並轉移至Eppendof管中。& Y) b: E, Q" l/ ^ Q: \$ s
2、 勻槳液在0-4℃放置4小時後,12000g離心30分鍾。 x- C6 D- N/ N0 K! t2 a
3、 取沉澱,加入原勻槳液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液,重復步驟2。
) y- x) S0 K9 y6 j, e4、 沉澱用原勻槳液1/2體積的氯化鋰-尿素溶液復溶後,加入等體積酚/氯仿/異戊醇在室溫放置15-30分鍾並不時搖動混勻,4000g離心5分鍾。
3 d2 v' i1 ~( ~* D5、 取上層水相,加1/10倍體積的3M乙酸鈉(pH5.2)及2倍體積的乙醇,-20℃放置1小時,5000g離心。
L4 a' Q4 u" l: a* K% Z$ ?( e6、 70%乙醇洗沉澱一次。真空乾燥。3 }; r0 [/ Q' G9 q
7、 RNA溶解液溶解沉澱,得RNA,分裝,於-70℃保存。
0 f. X% R( H% B7 g
! y7 j5 u$ C' |) [% ~! J3 D: Q蛋白酶-熱酚法6 |" ^0 b* [) P3 S* c4 b4 H4 l
本方法適合於病毒RNA的提取
* I( i+ b# r! K試驗試劑:
$ ?4 [7 H9 `) J1、 蛋白酶K(終濃度50ug/ml), J5 p l6 V/ t7 [/ I
2、 2×緩沖液:1%SDS? 20mMTris-HCL (pH 7.6)? 0.2MnaCL9 h, p ] y+ \$ Z) O
試驗步驟:# W3 v8 G1 [$ ]5 y
1、 提純病毒液中加入等體積緩沖液、蛋白酶K,37℃40-50分鍾。
- K0 p/ E' G0 M# Q- z7 n, {# d2、 加入等體積65℃預熱的酚溶液,輕徭,在65℃保溫5分鍾後再輕徭。
w! `; W( ~, E: i3 ^3、 離心,取上清,氯仿抽提一次。, |( Z0 d; j2 @7 m+ d2 Q& x H
4、 取上層水相,加1/10倍體積的3M乙酸鈉(pH5.2)及2倍體積的乙醇,-20℃放置1小時,5000g離心(10000g,10min)。
7 [/ w, h2 d6 U$ k5、 70%乙醇洗沉澱一次。真空乾燥。
% A5 Y; {( w% ]3 a* y, O e) P6、 RNA溶解液溶解沉澱,得RNA,分裝,於-70℃保存。植物RNA提取過程中難點的相應對策
㈣ 請告訴我一些是RNA的酶的例子
23SRNA的實抄質是肽醯轉移酶,催化使肽鍵襲形成,不需要額外的能量在蛋白質合成過程中,它催化核糖體A位tRNA上末端氨基酸的氨基與P位肽醯-tRNA上氨基酸的羧基間形成肽鍵。其結果,使A位的氨醯-tRNA上的多肽延長了一個氨基酸,而P位的氨醯-tRNA形成脫氨醯-tRNA。
㈤ 然後如何去除DNA中的RNA酶
(一)從源頭控制污染:
(1)玻璃製品、塑料製品和電泳槽 滅菌的一次性使用的塑料製品基本上無RNA酶,可以不經預處理直接用於制備和貯存RNA。實驗室用的普通玻璃器皿和塑料製品經常有RNA酶法染,使用前必須於180 ℃干烤8小時或更長時間(玻璃器皿)或用氯仿沖洗(塑料製品)。另一種方法是用0.1 %焦碳酸二乙酯(DEPC)的水溶液浸泡用於制備RNA的燒杯,試管和其他用品。DEPC是RNA酶的強烈抑制劑,但其作用並不是絕對的(Fedorcsak和Ehrenberg,1966)。灌滿DEPC的玻璃或塑料器皿在37℃放置2小時,然後用滅菌水淋洗數次, 並於100℃干烤15分鍾(Kumar和Lindberg,1972)。在15 lbf/in2(1.034x105Pa)高壓蒸氯滅菌15分鍾。上述處理可以除去器甲上痕量的DEPC,以防DEPC通過羧甲基化作用對RNA的嘌呤鹼基進行修飾。
用於RNA電泳的電泳槽應用去污劑洗干凈,再用水沖洗,用乙醇乾燥,然後灌滿3%的H2O2溶液,於室溫放置10分鍾,然後用0.1 %DEPC處理過的水徹底沖洗電泳槽。最好能留出一些玻璃器皿、塑料製品和電泳槽作上特殊標記,存放在指定地點,為RNA實驗專用。
(2)研究人員造成的污染 RNA酶最主要的潛在污染源是研究人員的手。因此,在准備分離的和分析RNA的材料和溶液時,主有涉及RNA的一切操作過程中,都應戴一次性手套,接觸「胖的」玻璃器皿和其他物品以後,手套就可能沾染上RNA酶,因此進行RNA實驗時應勤換手套。
(3)污染的溶液 用高壓滅菌的水和RNA研究專用的化學試劑配製溶液,用干烤過的葯匙稱取試劑,將溶液裝入無RNA酶的玻璃器皿。可能的話溶液均應用0.1%DEPC於37℃至少處理12小時,然後於100℃加熱15分鍾或在15lbf/in2(1.034x105Pa)的高壓下蒸氣滅菌15分鍾。註:DEPC可與胺類迅速發生化學反應,因些不能用來處理含有Tris 一類的緩沖液。可存幾瓶新的未開封的Tris晶體以制備無RNA酶的溶液。
(二)已經污染,可以加入RNA酶的抑制劑
(1)RNA酶的蛋白質抑制劑是 從人胎盤分離的一種蛋白質可與多種RNA酶緊密結合(KI≈3x1010)形成非共價結合的等摩爾復合物,使RNA酶失活。此蛋白質體內可能是血管生成素的抑制劑,血管生成素是氨基酸序列和推測的三級結構與胰RNA酶類似的一種血管生成因子, 幾個廠家以不同的商品名出售這種抑制劑,該蛋白質應置於含5mmol/L二硫蘇糖醇(DTT)的50%甘油中,貯存於-20℃。抑制劑製品凍融數次後或放置在氧化條件下即應棄之不用,因為上述處理會使蛋白質變性從而釋放出所結合的RNA酶。因此,在使用變性劑裂解哺乳動物(mammal;mammalian)細胞這一提取RNA的初始步聚中不應使用這種蛋白抑制劑。然而職用更溫和的裂解方法時應使用這種抑制劑,並且在後續的所有RNA純化步驟中均應有此蛋白質存在。由於酚抽提可以除蛋白質抑制劑,故應在純化過程中補加幾次抑制劑。其最大活性的發揮要求巰基試劑,而且它並不幹擾反轉錄或mRNA在無細胞體系中的翻譯。
(2)氧釩核糖核苷復合物 這種由氧釩(1V)離子和4種核糖核苷之中的任意一種所形成的復合物,是量種過渡態類似物,它能與多種RNA酶結合並幾科能百分之百地抑制RNA酶的活性。這4種氧釩核糖核苷復合物可加入完整細胞中,在RNA提取和純化的所有過程中,其使用濃度都是10mmol/L。所得到的mRNA可直接在硅卵母細胞中進行翻譯, 並能作為某些外酶促反應(如mRNA反轉錄)的模板。然而氧釩核糖核苷復合物強烈抑制mRNA在無細胞體系中的翻譯,因此必須用含0.1 %羥基喹淋的苯酚[ 用0. 01mol/LTris.Cl(pH7.8)平衡]多次抽提以去除之。有幾家公司出售氧釩核糖核苷復合物。
(3)Macaloid(硅藻上)Macaloid是一咱粘土,很多年前就發現它能吸附RNA酶,用緩沖液將其製成漿液,以0.015%(W/V)的終濃度溶解細胞。 這種粘土隨同它所吸附的RNA酶可在後續的RNA純化過程中(如酚抽提後)經離心去除。
(三)提取核酸時可以加入鹽酸胍或硫氰酸胍溶液。鹽酸胍或硫氰酸胍溶液能迅速溶解蛋白質,從而免受RNA酶的干擾。
㈥ RNA類酶都有哪些
種類數量比較少,而且不常見,比如端粒酶,在細胞中負責端粒的延長的一種酶,是基內本的核蛋白逆容轉錄酶,可將端粒DNA加至真核細胞染色體末端.端粒酶,核酶,RNA聚合酶,逆轉錄酶。
核酶,主要指一類具有催化功能的RNA,亦稱RNA催化劑.自然界中已發現多種核酶,目前主要有四種核酶能用於反式切割靶RNA:四膜蟲自身剪接內含子、大腸桿菌RNase P,錘頭狀核酶和發夾狀核酶。
rRNA,是核糖體上的酶。
拓展資料:
核酸分解的第一步是水解核苷酸之間的磷酸二酯鍵,在高等動植物中都有作用於磷酸二酯鍵的核酸酶。不同來源的核酸酶,其專一性、作用方式都有所不同。有些核酸酶只能作用於RNA,稱為核糖核酸酶(RNase)。
㈦ rnase a酶能與sds結合么
如何去除提取過程中的蛋白質污染提取RNA時如何去除DNA的污染的方法:注意實驗室的標准化問題,注意污染的存在,同時嚴格按照說明書上的操作應該沒有問題。發現DNA污染,用DNAseI消化1小時,37度離心取上清的時候,一定要小心不要取到中間的膜和下面的液體。直接加NaOH溶液與提取液混合攪拌,然後離心就可以了.因為RNA可溶於NaOH溶液,而DNA不可溶,離心後的上清液就不含有DNA了。RNA提取步驟:1.勻漿處理:①組織將組織在液氮中磨碎,每50-100mg組織加入1mlTRIzol,用勻漿儀進行勻漿處理。樣品體積不應超過TRIzol體積10%。②單層培養細胞直接在培養板中加入TRIzol裂解細胞,每10cm2面積(即3.5cm直徑的培養板)加1ml,用移液器吸打幾次。TRIzol的用量應根據培養板面積而定,不取決於細胞數。TRIzol加量不足可能導致提取的RNA有DNA污染。③細胞懸液離心收集細胞,每5-10×106動物、植物、酵母細胞或1×107細菌細胞加入1mlTRIzol,反復吸打。加TRIzol之前不要洗滌細胞以免mRNA降解。一些酵母和細菌細胞需用勻漿儀處理。2.將勻漿樣品在室溫(15-30℃)放置5分鍾,使核酸蛋白復合物完全分離。3.可選步驟:如樣品中含有較多蛋白質,脂肪,多糖或胞外物質(肌肉,植物結節部分等)可於2-8℃10000×g離心10分鍾,取上清。離心得到的沉澱中包括細胞外膜,多糖,高分子量DNA,上清中含有RNA。處理脂肪組織時,上層有大量油脂應去除。取澄清的勻漿液進行下一步操作。4.每使用1mlTRIzol加入0.2ml氯仿,劇烈振盪15秒,室溫放置3分鍾。5.2-8℃10000×g離心15分鍾。樣品分為三層:底層為黃色有機相,上層為無色水相和一個中間層。RNA主要在水相中,水相體積約為所用TRIzol試劑的60%。6.把水相轉移到新管中,如要分離DNA和蛋白質可保留有機相,進一步操作見後。用異丙醇沉澱水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0.5ml異丙醇,室溫放置10分鍾。7.2-8℃10000×g離心10分鍾,離心前看不出RNA沉澱,離心後在管側和管底出現膠狀沉澱。移去上清。8.用75%乙醇洗滌RNA沉澱。每使用1mlTRIzol至少加1ml75%乙醇。2-8℃不超過7500×g離心5分鍾,棄上清。9.室溫放置乾燥或真空抽干RNA沉澱,大約晾5-10分鍾即可。不要真空離心乾燥,過於乾燥會導致RNA的溶解性大大降低。加入25-200μl無RNase的水或0.5%SDS,用槍頭吸打幾次,55-60℃放置10分鍾使RNA溶解。如RNA用於酶切反應,勿使用SDS溶液。RNA也可用100%的去離子甲醯胺溶解,-70℃保存。注意事項:從少量樣品(1-10mg組織或102-104細胞)中提取RNA時可加入少許糖原以促進RNA沉澱。例如加800mlTRIzol勻漿樣品,沉澱RNA前加5-10μgRNase-free糖原。糖原會與RNA一同沉澱出來,糖原濃度不高於4mg/ml是不影響第一鏈的合成,也不影響PCR反應。勻漿後加氯仿之前樣品可以在-60至-70℃保存至少一個月。RNA沉澱可以保存於75%酒精中2-8℃一星期以上或-5至-20℃一年以上。分層和RNA沉澱時也可使用台式離心機,2600×g離心30-60分鍾。預期產量:1mg組織或1×106細胞提取RNA分別為:肝和脾6-10μg,腎3-4μg,骨骼肌和腦組織1-1.5μg,胎盤1-4μg,上皮細胞8-15μg,成纖維細胞5-7μg。
㈧ DNA聚合酶,解旋酶,RNA聚合酶各自的作用對象和作用時期(詳細)
DNA聚合酶以脫氧核苷酸三磷酸(dATP、dCTP、dGTP、或dTTP,四者統稱dNTPs)為作用對象,作用時期為DNA復制時期。
解旋酶以DNA雙鏈的氫鍵為作用對象,作用時期為DNA或RNA復制時期。
RNA聚合酶以四種核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)為作用對象,作用時期為轉錄時期。
(8)去離子甲醯氨rna酶擴展閱讀
1、DNA聚合酶特性
聚合作用:在引物RNA-OH末端,以dNTP為底物,按模板DNA上的指令,即A與T,C與G的配對原則,逐步逐個、連續地將dNTP加到延伸中的DNA分子3'-OH末端,逐步合成延長中的子鏈DNA。這是DNA聚合酶的主要作用;
3』→5』'外切酶活性(校對作用):這種酶活性的主要功能是從3』→5』方向識別和切除不配對的DNA生長鏈末端的核苷酸,3』→5』外切酶活性的主要功能是校對作用,當加入的核苷酸與模板不互補而游離時則被3』→5』外切酶切除,
以便重新在這個位置上聚合對應的核苷酸,可見,3』→5』外切酶活性對DNA復制真實性的維持是十分重要的。以保證復制過程的保真性和准確性;
5』→3』外切酶活性(切除修復作用):該活性是從5』→3』方向水解DNA延長鏈前方的DNA鏈(即只對DNA上雙鏈處的磷酸二酯鍵有切割作用),主要產生5'—脫氧核苷酸。這種酶活性在DNA損傷的修復中可能起著重要作用。
2、DNA解旋酶(DNA helicase)
通常為流體蛋白環,通過ATP水解產生的能量由解旋酶裝載器裝載到DNA單鏈上(單鏈穿過環中央),有3』→5』或5』→3』方向極性,該極性就是它結合的單鏈的極性。它像DNA聚合酶一樣具有延伸性。
與解旋酶裝載器結合,裝載到單鏈DNA上之前,DNA解旋酶是沒有活性的,只有解旋酶裝載器將它裝載到單鏈DNA上,解旋酶裝載器自動離開之後,DNA解旋酶的活性才被激活。直到雙鏈全部解開,運動到單鏈末端時,它才從單鏈上離開。
注意DNA解旋酶結合的是DNA單鏈而不是雙鏈,至於它結合的單鏈,是由起始子蛋白作用到被稱為復制器的DNA區段使該區段發生雙鏈解旋才產生的。
3、RNA聚合酶
該酶需要四種核糖核苷酸三磷酸(NTP:ATP、GTP、CTP、UTP)作為RNA聚合酶的底物,DNA為模板,二價金屬離子Mg2+、Mn2+是該酶的必需輔因子。其催化的反應表示為:(NMP)n+NTP→(NMP)n+1+PPi。RNA鏈的合成方向也是5』→3',第一個核苷酸帶有3個磷酸基。
其後每加入一個核苷酸脫去一個焦磷酸,形成磷酸二酯鍵,焦磷酸迅速水解的能量驅動聚合反應。與DNA聚合酶不同,RNA聚合酶無須引物,它能直接在模板上合成RNA鏈;RNA聚合酶能夠局部解開DNA的兩條鏈,所以轉錄時無須將DNA雙鏈完全解開,RNA聚合酶無校對功能。
㈨ 請問什麼是RNA 酶
酶的習慣命名抄根據兩個原則:
1.根據酶所催化的底物:如水解澱粉的酶稱為澱粉酶,水解蛋白質的稱為蛋白酶;有時還加上來源,以區別不同來源的同一類酶,如胃蛋白酶、胰蛋白酶等等。
2.根據酶所催化的反應類型:催化底物分子水解的稱為水解酶,催化還原反應的稱為還原酶。
也有根據上述兩項原則綜合命名或加上酶的其它特點,如琥珀酸脫氫酶、鹼性磷酸酶等等。
因此RNA酶是指作用底物為RNA的酶,例如RNA聚合酶。
核酶一詞用於描述具有催化活性的RNA, 即化學本質是核糖核酸(RNA), 卻具有酶的催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子, 有些作用底物就是同一RNA分子中的某些部位。核酶的功能很多,有的能夠切割RNA, 有的能夠切割DNA, 有些還具有RNA 連接酶、磷酸酶等活性。
與蛋白質酶相比,核酶的催化效率較低,是一種較為原始的催化酶。
水解RNA,DNA的可以稱為核酸水解酶,簡稱核酸酶。
㈩ 核酸雜交液中的甲醯胺是那種呢單純的甲醯胺還是去離子甲醯胺,還是別的甲醯胺,謝謝
核酸雜交液中的甲醯胺一般用去離子甲醯胺。